纯白色交响曲漫画是根据同名美少女游戏改编而成！纯白色交响曲漫画的主人公—瓜生新吾是天生下人命，他所上的是一所男女通校，但即将和在同一条街的一所名门女子学校合并！从10月开始的预备合并期内，作为男女通校这边选出来的学生代表的一员，新吾开始到女校上学，但是等待他的是与性格各异的少女的相遇，以及她们对男生的排斥，经常被当做空气而疲于奔命的新吾，这时候该……